Vaasan lentoaseman pysäköintialue ja -käytännöt ovat muuttuneet syyskuun alusta lähtien. Pysäköintipaikat on jaettu kolmeen alueeseen käyttötarkoituksen mukaan.
Terminaalin eteen on varattu mahdollisimman paljon tilaa matkustajien ja matkatavaroiden jättämistä varten. Terminaalin edustalla sijaitsevat pysäköintipaikat on tarkoitettu viiden minuutin pysähdystä varten.
P1 on lyhytaikaiseen pysäköintiin tarkoitettu alue. Kävelymatkaa autolta terminaaliin on noin 30 metriä. Pysäköintialue soveltuu hyvin myös saattajien ja vastaanottajien tarpeisiin.
P2 on pääpysäköintialue, joka tarjoaa lentoaseman asiakkaiden käyttöön lähes 700 pysäköintipaikkaa. Matkustajat ja alueella asioivat voivat pysäköidä autonsa P2 -alueelle 25 minuutin ajan ilmaiseksi. Ilmainen pysäköinti tapahtuu syöttämällä pysäköintilipuke ulosajopuomilla eli maksuautomaatilla käyminen ei ole tarpeen. Kun 25 minuuttia tulee täyteen, veloitetaan pysäköinnistä hinnaston mukaisesti.
Lentokentän pysäköintiä valvoo vastedes Vaasan kaupungin pysäköinninvalvonta.