Britannian aikeet erota Euroopan unionista ovat herättäneet suurta huolta Pohjois-Irlannissa. Yhdistyneisiin kansankuntiin kuuluvassa maassa pelätään, että brexitin myötä Pohjois-Irlannin ja Irlannin rajalle palaavat vartijat ja tarkastuspisteet. Ne poistettiin vuonna 1998, kun Belfastin rauhansopimus solmittiin.

Brexitin toteutuessa Pohjois-Irlannin ja Irlannin tasavallan välisestä rajasta muodostuu EU:n yhteismarkkinoiden ulkoraja. Tällöin rajalle tulisi tulliasemia ja hankalia rajamuodollisuuksia.